Amplicon sequencing analysis pipeline through qiime2 platform 置顶 | Posted on 2020-09-28 Edited on 2020-09-29 In OmicsData , Amplicon-seq Valine: Symbols count in article: 16k Reading time ≈ 14 mins. qiime2是扩增子数据分析的最佳平台之一,其提供了大量从原始data到统计分析的插件,尤其是它的可重复分析且可扩展插件的理念使得其成为扩增子分析首选的平台。 Read more »
R包:ggpubr傻瓜式绘图包 Posted on 2021-11-29 In R , Packages Valine: Symbols count in article: 13k Reading time ≈ 12 mins. ggpubr是我经常会用到的R包,它傻瓜式的画图方式对很多初次接触R绘图的人来讲是很友好的。 Read more »
转录组差异分析(DESeq2+limma+edgeR+t-test/wilcox-test)总结 Posted on 2021-11-26 In Math , Statistics Valine: Symbols count in article: 45k Reading time ≈ 41 mins. 差异分析是转录组数据分析的必备技能之一,但众多的转录组分析R包*DESeq2*,*limma*和*edgeR*让分析人员有选择问题,那么它们之间的优劣到底是如何的呢? Read more »
如何安装R包 Posted on 2021-11-24 In R , Packages Valine: Symbols count in article: 3.2k Reading time ≈ 3 mins. R语言提供的大量R包为众多研究者提供了足够的工具,但是如何安装R包是很多人在使用R语言做数据分析时候所面临的问题之一。 Read more »
clustlasso: 基于聚类分析的特征选择分类包 Posted on 2021-11-21 In R , Packages Valine: Symbols count in article: 4.9k Reading time ≈ 4 mins. clustlasso是结合lasso和cluster-lasso策略的R包,并发表在Interpreting k-mer based signatures for antibiotic resistance prediction。 Read more »